SARS-CoV-2

Wikipedia Minangkabau - Lubuak aka tapian ilimu
Loncat ke navigasi Loncat ke pencarian
SARS-CoV-2
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 Edit the value on Wikidata
SARS-CoV-2 (CDC-23312).png
Ilustrasi virus 2019-nCoV yang dibuat oleh Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit (CDC).
3D medical animation coronavirus structure.jpg
Model potongan lintas seksional 2019 nCoV yang menunjukkan komponen virus
Rekaman (id) Terjemahkan
Edit the value on Wikidata
Data (id) Terjemahkan
Inang (id) Terjemahkan Homo sapiens, Trenggiling biasa (id) Terjemahkan, kucing (id) Terjemahkan jo Canis familiaris (en) Terjemahkan Edit the value on Wikidata
Komposisi genom virus ICTV (id) Terjemahkan positive-sense single-stranded RNA virus (en) Terjemahkan Edit the value on Wikidata
Panyakik Wabah panyakik koronovirus 2019–2020 jo Panyakik koronavirus 2019 Edit the value on Wikidata
Jumlah genom (id) Terjemahkan 29.903 Edit the value on Wikidata
Taksonomi
SuperdomainBiota
KerajaanVirus
DuniaRiboviria
OrdoNidovirales
FamiliCoronaviridae
UpafamiliOrthocoronavirinae
GenusBetacoronavirus
UpagenusSarbecovirus
SpesiesSevere acute respiratory syndromeKladrelated coronavirus
Indak ado nilaiSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 Edit the value on Wikidata
Tata nama (id) Terjemahkan
Asal namo SARS-CoV (id) Terjemahkan Edit the value on Wikidata
Sinonim takson (id) Terjemahkan
  • Koronavirus Wuhan
  • Virus pneumonia pasar makanan laut Wuhan
Ubah di Wikidata

Virus korona baru, ditandokan 2019-nCoV oleh Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) (Hanzi: 2019新型冠狀病毒)[1][2] adalah salah satu anggota virus korona nan kanai infeksi panapasan. Virus iko partamo kali diidentifikasi di Kota Wuhan, Tiongkok dan manyababkan wabah koronavirus baru 2019–2020. Virus iko juga tanamo sabagai virus korona wuhan (Hanzi sederhana: 武汉冠状病毒; Hanzi tradisional: 武漢冠狀病毒), dan virus pneumonia pasa makanan lawik wuhan (Wuhan seafood market pneumonia virus).

Genom virus iko alah diurutkan.[3][4][5] Pabandiangan urutan genetik antaro virus iko dan sampel virus lain manunjuakkan tingkek kasamoan jo SARS-CoV sagadang 79,5% dan jo virus korona kalalawa sagadang 96%. Babarapo teori bapandapek virus iko barasal dari kalalawa.

Epidemiologi[suntiang | suntiang sumber]

Panyakit akibat infeksi 2019-nCoV pado urang pertama kali tajadi pado mulo Desember 2019. Pendekatan jam molekuler manyatokan wakatu infeksi nan sarupo atau saketek labiah dulu.[6] Wabah panyakit partamo kali tadeteksi di Kota Wuhan, Provinsi Hubei, Tiongkok pado patangahan Desember 2019. Virus iko kamudian malaweh ka Thailand (Bangkok); Jepang (Tokyo); Korea Selatan (Seoul); provinsi lain di Tiongkok Daratan; Hong Kong; Taiwan (Taoyuan); dan kamudian ka dunia internasional. Korban jiwa bajumlah 426 urang nan sabagian gadang barado di Wuhan dan sakitarnyo, dengan 20.626 kasus per 4 Februari 2020.[7]

Pado 30 Januari 2020, wabah akibat 2019-nCoV ditatapkan sabagai darurat kesehatan global oleh Organisasi Kesehatan Dunia (WHO).[8][9] WHO manciptakan istilah samantaro "panyakik panapasan akut 2019-nCoV" untuak manggambarkan panyakik nan disebabkan oleh virus iko.

Panularan[suntiang | suntiang sumber]

Panularan dari urang ka urang dikonfirmasi di Guangdong, Tiongkok. Babarapo laporan manyatokan bahwa virus alah basifat infeksius bahkan ketiko dalam maso inkubasi.[10]

Para ilmuwan alah manaliti angko reproduksi dasar (R0) nan dipunyo virus iko. Dalam epidemiologi, angko iko manunjuakkan jumlah infeksi baru nan diangkek di satiok urang nan tainfeksi. Salah satu panaliti manyatokan bahwa setiok urang nan tainfeksi manular virus ka antaro 3 hinggo 5 urang. Panalitian lain mampakirokan R0 sagadang 1,4 hinggo 3,8. Selain itu, virus iko diketahui talok manular dalam rantai infeksi sabanyak ampek urang.[11]

Pangobatan[suntiang | suntiang sumber]

Saat iko indak ado ubek khusus untuak 2019-nCoV sehinggo parawatan difokuskan pado pengurangan gajala. Pusat Pangandalian dan Pancegahan Panyakit Tiongkok (CDC Tiongkok) sedang manguji prosedur parawatan pneumonia nan ado ada untuak diterapkan pado pneumonia akibat virus korona.[12]

Panggunoan ubek antivirus nan ado sadang diteliti, tamasuak protease inhibitor sarupo indinavir, saquinavir, remdesivir, lopinavir/ritonavir dan interferon beta. Efektivitas antibodi monoklonal nan alah diidentifikasi juo sadang diselidiki.[13]

Pado 2 Februari 2020, Thailand malaporkan pengobatan nan barasil untuak ciek pasien. Dr. Kriengsak Attipornwanich dari Umah Sakit Rajavithi di Bangkok mangatokan saat konferensi pers Kementerian Kesehatan Thailand, seorang padusi Tiongkok baumua 71 tahun dari Wuhan dinyatokan negatif virus korona 48 jam sasudah dokter maagiah ubet anti-HIV lopinavir dan ritonavi dalam kombinasi jo ubet influenza oseltamivir.[14]

Virologi[suntiang | suntiang sumber]

Replikasi virus dari virus korona.

Pado 22 Januari 2020, Journal of Medical Virology manabikkan laporan analisis genom nan manjalehkan bahwa ula di daerah Wuhan adalah "reservoir binantang lia nan paling mungkin" untuk virus iko, tapi diparalukan labiah banyak panalitian. Rekombinasi homolog mungkin manyababkan peristiwa iko. Babarapo ilmuwan picayo bahwa panyakik iko bamulo dari Bungarus multicinctus, ula nan paliang babiso nan dijua di pasa Wuhan.[15] Berito di Nature mengkritik artikel Journal of Medical Virology dengan manyatokan bahwa ula paliang indak mungkin manjadi reservoir, dan labiah mungkin pado mamalia. Banyak virolog juga paliang maragukan peranan ula sabagai inang parantaro.

Salamo 17 tahun panalitian tantang asal-mulo epidemi SARS 2003, banyak virus korona kalalawa nan manyarupoi SARS (SARS-like) diisolasi dan diurutkan, kabanyakan dari inyo barasal dari genus Rhinolophus. Dengan genom nan cukuik, rekonstruksi batang filogenetik untuak tau sejarah mutasi virus korona dapek dilakukan.

Virus korona baru iko (2019-nCoV) barado dalam kategori virus korona nan manyarupoi SARS. Duo urutan genom dari Rhinolophus sinicus dengan kamiripan 80% alah dipublikasikan pado tahun 2015 dan 2017.[16] Samantaro itu, artikel pracetak di jurnal bioRxiv nan ditulis oleh panaliti dari Institut Virologi Wuhan, Umah Sakit Jinyintan Wuhan, Universitas Akademi Sains Tiongkok, dan CDC Provinsi Hubei manyatokan bahwa virus korona iko kamungkinan barasal dari kalalawa, karano analisis inyo manunjuakkan bahwa nCoV-2019 punyo kamiripan 96% jo koronavirus kalalawa nan diisolasi dari kalalawa Rhinolophus affinis.[17] Sabagai pabandiangan, jumlah mutasi ko mirip jo jumlah mutasi nan diparatikan salamo 10 tahun pado flu manusia H3N2.

Binatang nan dijua sabagai makanan dicurigai sabagai reservoir atau perantaro virus kareno banyak dari individu na tainfeksi partamo kali adolah pakarajo di Pasa Makanan Lawik Huanan. Akibatnyo, inyo tapapar kontak nan labiah gadang jo binantang.

Filogenetik jo taksonomi[suntiang | suntiang sumber]

Templat:Infobox genomeVirus 2019-nCoV tagolong dalam genus Betacoronavirus (Beta-CoV) dalam kaluarga Coronaviridae. Panyakik nan disebabkan Coronaviridae dapek bakisar dari pilek biaso hinggo panyakik nan labiah parah sarupo sindrom pernapasan Timur Tengah (MERS) dan sindrom pernapasan akut berat (SARS). Virus korona adolah kaluarga virus nan laweh, tapi hanyo anam virus (229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV, dan SARS-CoV) nan sabalunyo diketahui mainfeksi uang; 2019-nCoV merupokan bantuak katujuah nan mainfeksi urang.

Urutan genom betacoronavirus Wuhan manunjuakkan kasamoan jo betacoronavirus nan ditamukan pado kalalawa. Namun, virus iko sacaro genetik babeda dari coronavirus lain sarupo coronavirus terkait SARS dan MERS.[5] Genus betacoronavirus tadiri ampek garis katurunan (subgenus), 2019-nCoV basamo jo SARS-CoV digolongkan dalam garis katurunan B (subgenus Sarbecovirus).[18]

Sajumlah genom virus korona baru iko alah diisolasi dan dilaporkan tamasuak BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019, BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019, dan BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019 dari CDC Tiongkok, Institut Biologi Patogen, dan Umah Sakit Jinyintan Wuhan.[5][19][20] Panjang urutan RNA nan dimilikinyo sakitar 30 kbp. Model struktural komparatif dari protease koronavirus 2019-nCoV disadiokan oleh Innophore GmbH, dengan babarapo pacuboan ubek malawan inhibitor protease virus alah dilakukan.[21] Analisis filogenetik untuak sampel disadiokan oleh Nextstrain.[22]

Struktur biologi[suntiang | suntiang sumber]

Diagram pita Innophore Phyre2 dari Protease 2019-nCoV, target prospektif untuak ubat antivirus[23]

Publikasi genom mambari jalan pado babarapo pemodelan protein untuak protein pangiket reseptor (RBD), adolah protein spike (S). Protein S diketahui mampatahankan afinitas nan cukuik terhadap reseptor enzim pengubah angiotensin 2 (ACE2) dan manggunokannyo untuak masuak ka dalam sel.[24] Pado 22 Januari, dua kalompok nan babeda (ciek di Tiongkok nan bakarajo jo virus cukuik dan ciek di AS nan bakarajo jo genetik baliak) secaro independen menunjuakkan paranan ACE2 sabagai reseptor untuak 2019-nCoV.[25][26][27]

Untuak mancari protease inhibitor nan potensial, enzim endopeptidase C30 dari poliprotein rangka baco tabuka 1a (Orf1a) juga dimodelkan untuak percobaan docking ubek. Innophore alah mahasilkan duo model komputasi badasarkan protease SARS,[23] dan Akademi Ilmu Pengetahuan Tiongkok alah mahasilkan struktur eksperimental rekombinan protease 2019-nCoV nan alun dipublikasikan [28]

Pengembangan vaksin[suntiang | suntiang sumber]

Pado bulan Januari 2020, babarapo organisasi dan lembaga mulai bakarajo untuak mambuek vaksin untuak virus korona Wuhan badasarkan genom nan dipublikasikan.[29][30] Di Tiongkok, CDC Tiongkok sadang mangambangkan vaksin untuak virus 2019-nCoV.[31][32]

Tigo proyek vaksin sadang didukuang oleh Koalisi Inovasi Kesiapsiagaan Epidemi (CEPI), tamasuak ciek proyek perusahaan bioteknologi Moderna dan proyek lainnyo oleh Universitas Queensland Australia. Institut Kesehatan Nasional Amerika Serikat (NIH) bakarajo samo jo Moderna untuak mambuek vaksin RNA nan cocok jo protein permukaan (protein spike) virus korona, nan diharokkan untuak mamulai produksi pado Mei 2020.[29] Di Australia, Universitas Queensland sadang manyalidiki potensi vaksin penjepit molekuler nan sacaro genetik akan memodifikasi protein virus untuak mambueknyo maniru virus korona dan marangsang reaksi kekebalan.[33]

Dalam proyek independen, Agensi Kesehatan Masyarakat Kanada alah maizinkan Organisasi Vaksin dan Panyakik Menular-Pusat Vaksin Internasional (VIDO-InterVac) di Universitas Saskatchewan untuak mulai mangambangkan vaksin.[34] VIDO-InterVac manargetkan produksi vaksin dan pengujian terhadap binatang pado Maret 2020, dan pengujian terhadap manusia pado 2021.[30]

Fakultas Kedokteran Imperial College di London punyo dana untuak mangambangkan vaksin dan mambaoknyo ka pangujian binatang, fase panalitian nan diarokkan akan salasai pado partangahan Februari 2020.[35]

Rujuakan[suntiang | suntiang sumber]

  1. "Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV)". who.int. Diakses tanggal 21 Januari 2020. 
  2. "Novel coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China". cdc.gov. cdc.gov. 10 Januari 2020. Diakses tanggal 16 Januari 2020. 
  3. "中国疾病预防控制中心". chinacdc.cn. Diakses tanggal 9 Januari 2020. 
  4. "New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert". Diakses tanggal 9 Januari 2020. 
  5. a b c "CoV2020". platform.gisaid.org. Diakses tanggal 12 Januari 2020. 
  6. Cohen, Jon (26 Januari 2020). "Wuhan seafood market may not be source of novel virus spreading globally". Science | AAAS (dalam bahasa Inggris). 
  7. 黃金棋陳倩婷李恩慈勞敏儀侯彩琳. "消息:香港首確診患者二次化驗陽性 轉送瑪嘉烈醫院" (dalam bahasa Tionghoa). DXY. Diakses tanggal 25 Januari 2020. 
  8. "Virus corona: Wabah terus menyebar ke sejumlah negara di luar China, WHO nyatakan 'darurat kesehatan global'". BBC Indonesia. 30 Januari 2020. Diakses tanggal 31 Januari 2020. 
  9. Dio Prasasti, Giovani (30 Januari 2020). "Resmi, WHO Nyatakan Wabah Virus Corona Darurat Kesehatan Global". Liputan6.com. Diakses tanggal 31 Januari 2020. 
  10. "专家:病毒潜伏期有传染性 有人传染同事后才发病". news.163.com (dalam bahasa CN). 26 Januari 2020. 
  11. Saey, Tina Hesman (24 Januari 2020). "How the new coronavirus stacks up against SARS and MERS". Diarsipkan dari versi asli tanggal 25 Januari 2020. Diakses tanggal 25 Januari 2020. 
  12. "China CDC developing novel coronavirus vaccine". Xinhua. 26 Januari 2020. 
  13. "Coronavirus: Vir Biotechnology and Novavax announce vaccine plans-GB". Diakses tanggal 28 Januari 2020. 
  14. Nugraha, Fajar. "Dokter Thailand Klaim Temukan Penangkal Virus Korona". 
  15. SCIMEX (23 Januari 2020). "EXPERT REACTION: Could new coronavirus have come from snakes?". Scimex. Diakses tanggal 23 Januari 2020. 
  16. The 2019 new Coronavirus epidemic: evidence for virus evolution. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.24.915157v1. 
  17. Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin. Kasalahan: wakatu indak tapek. http://biorxiv.org/lookup/doi/10.1101/2020.01.22.914952. 
  18. "Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses". nextstrain. Diakses tanggal 18 Januari 2020. 
  19. "Initial genome release of novel coronavirus". Virological. 11 Januari 2020. Diakses tanggal 12 Januari 2020. 
  20. Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947.3. 
  21. Gruber, Christian; Steinkellner, Georg (23 Januari 2020). "Wuhan coronavirus 2019-nCoV - what we can find out on a structural bioinformatics level". Innophore Enzyme Discovery. Innophore GmbH. 
  22. Bedford, Trevor; Neher, Richard. "Genomic epidemiology of novel coronavirus (nCoV) using data generated by Fudan University, China CDC, Chinese Academy of Medical Sciences, Chinese Academy of Sciences, Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention and the Thai National Institute of Health shared via GISAID". nextstrain.org. Diakses tanggal 26 Januari 2020. 
  23. a b Gruber, Christian; Steinkellner, Georg (23 Januari 2020). "Wuhan coronavirus 2019-nCoV - what we can find out on a structural bioinformatics level". Innophore Enzyme Discovery. Innophore GmbH. 
  24. "Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission". SCIENCE CHINA Life Sciences. doi:10.1007/s11427-020-1637-5. http://engine.scichina.com/publisher/scp/journal/SCLS/doi/10.1007/s11427-020-1637-5. Diakses pado 23 Januari 2020. 
  25. "Functional assessment of cell entry and receptor usage for lineage B β-coronaviruses, including 2019-nCoV". BiorXiv. doi:10.1101/2020.01.22.915660. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.915660v1. Diakses pado 28 Januari 2020. 
  26. "Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin". BiorXiv. doi:10.1101/2020.01.22.914952. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v2. Diakses pado 24 Januari 2020. 
  27. "Return of the Coronavirus: 2019-nCoV". Viruses. doi:10.3390/v12020135. 
  28. "上海药物所和上海科技大学联合发现一批可能对新型肺炎有治疗作用的老药和中药". Akademi Ilmu Pengetahuan Tiongkok. 25 Januari 2020. 
  29. a b Steenhuysen, Julie; Kelland, Kate (25 Januari 2020). "With Wuhan virus genetic code in hand, scientists begin work on a vaccine". Thomson Reuters. Diakses tanggal 28 Januari 2020. 
  30. a b "Saskatchewan lab joins global effort to develop coronavirus vaccine". Canadian Broadcasting Corporation (dalam bahasa Inggris). 24 Januari 2020. Diakses tanggal 26 Januari 2020. 
  31. "China CDC developing novel coronavirus vaccine". Xinhua. 26 Januari 2020. Diakses tanggal 26 Januari 2020. 
  32. "Chinese scientists race to develop vaccine as coronavirus death toll jumps". CNBC Indonesia. 26 Januari 2020. Diakses tanggal 26 Januari 2020. 
  33. "Lessons from Sars outbreak help in race for coronavirus vaccine". The Guardian (dalam bahasa Inggris). 24 Januari 2020. Diakses tanggal 28 Januari 2020. 
  34. "Saskatchewan lab joins global effort to develop coronavirus vaccine". ca.news.yahoo.com. 26 Januari 2020. 
  35. Burley, Kay (27 Januari 2020). ""To get the vaccine into human studies would be about £1,500,000...to move it beyond that depends on how big the epidemic is." Imperial College's Prof Robin Shattock discusses the rush to develop a vaccine for coronavirus. JM #KayBurleypic.twitter.com/Pj1YABMufZ". @KayBurley. Diakses tanggal 4 Februari 2020.